Брегалничката епархија ја возглавува Неговото Вископреосвештенство митрополитот г. Иларион. Оваа епархија се протега на територијата на градовите: Штип, Радовиш, Кочани, Пробиштип, Свети Николе, Македонска Каменица, Делчево и Виница. Издавачката дејност во Епархијата е прилично развиена. Се јавуваат бројни црковно-канонски публикации. Брегалничката епархија го издава списанието „Троичник“, кој излегува од печат три пати годишно.
Најпознати манастири и цркви:
- Соборен храм „Св. Никола“, Штип
- Црква „Св. Троица“ – Радовиш
- Лесновски манастир – Св. Архангел Михаил
- Манастир Конче – Св. Стефан
- Манастир Пирог – Успение на Пресвета Богородица
- Црква Св. Јован Крстител, Штип
- Црква Св. Спас, Штип
- Црква Св. Архангел, Штип
- Црква Св. Никола, с. Крупиште
- Црква „Св. Илија“, Радовиш
- Манастир Св. Пантелејмон, с. Брест, Радовиш
Име Години на
управувањеМитрополит Брегалнички г. Стефан 12 јули 1986 – 9 октовмри 1999 Митрополит Брегалнички г. Агатангел 26 ноември 2000 – 7 октомври 2006 Митрополит Брегалнички г. Иларион 22 август 2006 – денес
